Iowa State University "s’offre" un supercalculateur pour séquencer le génome

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La Iowa State University vient d’investir dans l’achat d’un IBM Blue Gene/L équipé de 2048 processeurs (soit bien moins que les versions plus puissantes installées dans les laboratoires du DOE : jusqu’à plus de 100.000 processeurs). Cet investissement de 1,25 million de dollars a été financé pour moitié par l’université et pour moitié par la NSF. La machine peut atteindre 5,7 téraflops, ce qui la classe 73e au Top500 mondial et dispose d’une capacité de stockage de 11 téraoctets. Cela place l’université dans le Top 10 des universités américaines en matière de capacité de calcul. Ce supercalculateur sera d’abord utilisé pour le séquençage du génome du maïs (notamment pour pouvoir l’exploiter pour produire de l’éthanol ou des matières plastiques biodégradables) et pour mieux comprendre les réseaux d’interaction des protéines dans des organismes vivants. Cette université a par ailleurs des liens étroits avec le DOE pour le calcul à haute performance (avec lequel elle opère le Ames Laboratory et, via le Ames, le Scalable Computing Laboratory).

Source :


- ’Supercomputer for Iowa State University’, http://www.iastate.edu/~nscentral/news/2006/jan/supercomputer.shtml
- ’Supercomputer Meets Corn Genome’, http://www.technologyreview.com/TR/wtr_16219,323,p1.html
- ’Iowa State University supercomputer to help decipher corn genome’, http://www.signonsandiego.com/news/science/20060131-0040-farmscene-corncomputer.html

Rédacteur :

Jean-Philippe Lagrange, attache-stic.mst@ambafrance-us.org

Voir en ligne : http://www.bulletins-electroniques….